Studi Komparatif Molecular Docking Naringenin (Aglikon) dan Naringin (Glikosida) terhadap Enzim Enoyl-acyl carrier protein reductase (InhA) Mycobacterium tuberculosis
DOI:
https://doi.org/10.47575/mb.v2i1.869Keywords:
Tuberkulosis, InhA, Molecular Docking, Naringenin, NaringinAbstract
Tuberkulosis (TB) masih menjadi masalah kesehatan global akibat meningkatnya kasus resistensi obat khususnya terhadap isoniazid. Enzim enoyl-acyl carrier protein reductase (InhA) menjadi target penting karena berperan dalam biosintesis dinding sel Mycobacterium tuberculosis. Senyawa flavonoid seperti naringenin (aglikon) dan naringin (glikosida) berpotensi sebagai inhibitor InhA, namun perbandingan kelayakannya sebagai kandidat obat masih terbatas. Penelitian ini bertujuan membandingkan afinitas ikatan Delta G Naringenin (aglikon) dan Naringin (glikosida) terhadap InhA PDB ID: 4TZK serta memprediksi profil kelayakan obat (LogP dan kepatuhan Lipinski’s Rule) untuk mengidentifikasi kandidat obat yang paling realistis. Perbandingan dilakukan berdasarkan skor Delta G dan binding energy (dibandingkan dengan kontrol positif) serta evaluasi LogP dan kepatuhan drug-likeness menggunakan aturan Lipinski. Hasil molecular docking menunjukkan bahwa Naringin (glikosida) menghasilkan skor afinitas ikatan terbaik. Namun naringenin (aglikon) menunjukkan skor afinitas ikatan yang lebih baik dibandingkan kontrol positif (Isoniazid). Kesimpulan penelitian ini naringin unggul dalam skor binding energy mentah namun naringenin menjadi kandidat inhibitor InhA yang lebih baik karena mematuhi kriteria drug-likeness dan Lipinski’s Rule sehingga naringenin menjadi lebih realistis untuk pengembangan obat anti-TBs.
References
Rabaan, A. A., Alhumaid, S., Albayat, H., Alsaeed, M., Alofi, F. S., Al-Howaidi, M. H., Turkistani, S. A., Alhajri, S. M., Alahmed, H. E., Alzahrani, A. B., Mashraqi, M. M., Alwarthan, S., Alhajri, M., Alshahrani, F. S., Almuthree, S. A., Alsubki, R. A., Abuzaid, A. A., Alfaresi, M., Fares, M. A. A., & Mutair, A. A. (2022). Promising Antimycobacterial Activities of Flavonoids against Mycobacterium sp. Drug Targets: A Comprehensive Review. Molecules, 27(16), 1-15.
Anjani, I. A., Artha, I. W. W., Purwaningrum, N. M. A., Wiranata, S., Supadmanaba, I. G. P., & Wihandani, D. M. (2025). Potensi Kombinasi Naringenin-Liposom Sebagai Anti-Viral dan Anti-Fibrotik dalam Penatalaksanaan Hepatitis C. Jurnal Kesehatan Andalas, 9(2), 245–252. https://doi.org/10.25077/jka.v9i2.1280.
Bunalema, L., Fotso, G. W., Waako, P., Tabuti, J., & Yeboah, S. O. (2017). Potential of Zanthoxylum leprieurii as a source of active compounds against drug resistant Mycobacterium tuberculosis. BMC Complementary and Alternative Medicine, 17(1), 1-6. https://doi.org/10.1186/s12906-017-1602-x.
Fang, W.-Y., Ravindar, L., Rakesh, K. P., Manukumar, H. M., Shantharam, C. S., Alharbi, N. S., & Qin, H.-L. (2019). Synthetic approaches and pharmaceutical applications of chloro-containing molecules for drug discovery: A critical review. European Journal of Medicinal Chemistry, 173, 117–153. https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2019.03.063.
Farjallah, A., Chiarelli, L. R., Forbak, M., Degiacomi, G., Danel, M., Goncalves, F., Carayon, C., Seguin, C., Fumagalli, M., Záhorszká, M., Vega, E., Abid, S., Grzegorzewicz, A., Jackson, M., Peixoto, A., Korduláková, J., Pasca, M. R., Lherbet, C., & Chassaing, S. (2021). A Coumarin-Based Analogue of Thiacetazone as Dual Covalent Inhibitor and Potential Fluorescent Label of HadA in Mycobacterium tuberculosis. ACS Infectious Diseases, 7(3), 552–565. https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.0c00325.
Fitriasih, F., & Isfeni, H. (2025). Analisis Molecular Docking Senyawa Aktif Genistein Dari Tumbuhan Bunga Lili Terhadap Reseptor Esterogen Alpha Pada Kanker Payudara. Mantiq : Journal of Educational Science. 1(1). 37-46.
Gandu, I. V., Budiarso, F. D. H., Kepel, B. J., Fatimawali, ., Manampiring, A., & Bodhi, W. (2021). Molecular Docking Senyawa Asam Askorbat dan Kuersetin pada Tumbuhan Jambu Biji Merah (Psidium guajava L.) Sebagai Pencegah COVID-19. Jurnal E-Biomedik, 9(2), 170-175. https://doi.org/10.35790/ebm.v9i2.31846.
Global Programme on Tuberculosis and Lung Health (GTB). (2024). Tuberculosis: Multidrug-resistant (MDR-TB) or rifampicin-resistant TB (RR-TB). World Health Organization.
Klara, I. K., Purwono, R. M., & Achmadi, P. (2023). Analisis In Silico Senyawa Flavonoid Kayu Secang (Caesalpinia sappan L.) pada Reseptor α-Amilase Sebagai Antihiperglikemik. Acta Veterinaria Indonesiana, 11(3), 210–219.
Kastritis, P. L., & Bonvin, A. M. J. J. (2013). On the binding affinity of macromolecular interactions: daring to ask why proteins interact. Journal of The Royal Society Interface, 10(79). 1-27. https://doi.org/10.1098/rsif.2012.0835.
Nursanti, O. (2023). Prediksi Toksisitas Dan Farmakokinetika Untuk Mendapatkan Kandidat Obat Antidiabetes. Journal of Pharmaceutical Care and Sciences, 3(2), 1–9.
Pornprom, T., Pakamwong, B., Sukchit, D., Yuguchi, M., Nagura, Y., Sabishiro, H., Chimura, N., Punkvang, A., Thongdee, P., Suttisintong, K., Kittakoop, P., Kurita, N., & Pungpo, P. (2025). Designing Novel InhA Inhibitors for Antituberculosis Agents Using ab Initio Fragment Molecular Orbital Calculations. ACS Omega, 10(27), 29547–29557. https://doi.org/10.1021/acsomega.5c02912.
Sahu, N., Mishra, G., Chandra, H. K., Nirala, S. K., & Bhadauria, M. (2020). Naringenin mitigates antituberculosis drugs induced hepatic and renal injury in rats. Journal of Traditional and Complementary Medicine, 10(1), 26–35. https://doi.org/10.1016/j.jtcme.2019.01.001.
Wang, Y., Wang, S., Firempong, C. K., Zhang, H., Wang, M., Zhang, Y., Zhu, Y., Yu, J., & Xu, X. (2017). Enhanced Solubility and Bioavailability of Naringenin via Liposomal Nanoformulation: Preparation and In Vitro and In Vivo Evaluations. AAPS PharmSciTech, 18(3), 586–594. https://doi.org/10.1208/s12249-016-0537-8.
World Health Organization. (2022). Global Tuberculosis Report 2022. World Health Organization.
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
Copyright (c) 2025 Iqbal Wahid, Agatha Tyva Julian Atmajaningtyas, Putri Rovita Sari
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
